MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 1229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	GTC	2	6	11	16	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612082
2	NC_017640	TGACAC	2	12	28	39	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612082
3	NC_017640	AAC	2	6	48	53	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612082
4	NC_017640	GAA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612082
5	NC_017640	A	8	8	123	130	100 %	0 %	0 %	0 %	386612082
6	NC_017640	TGGATA	2	12	226	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612082
7	NC_017640	TGGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	386612082
8	NC_017640	TCAT	2	8	262	269	25 %	50 %	0 %	25 %	386612082
9	NC_017640	TTG	2	6	316	321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612082
10	NC_017640	TG	3	6	334	339	0 %	50 %	50 %	0 %	386612082
11	NC_017640	CTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612082
12	NC_017640	AG	3	6	632	637	50 %	0 %	50 %	0 %	386612082
13	NC_017640	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612082
14	NC_017640	ATG	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612082
15	NC_017640	AGTC	2	8	890	897	25 %	25 %	25 %	25 %	386612082
16	NC_017640	GCA	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
17	NC_017640	CCCG	2	8	1306	1313	0 %	0 %	25 %	75 %	386612083
18	NC_017640	CCAG	2	8	1401	1408	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
19	NC_017640	GT	3	6	1473	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	386612083
20	NC_017640	TCG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612083
21	NC_017640	ACG	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
22	NC_017640	GTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612083
23	NC_017640	ATC	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612083
24	NC_017640	CGCA	2	8	1691	1698	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
25	NC_017640	CACT	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	386612083
26	NC_017640	CAG	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
27	NC_017640	TTC	2	6	1906	1911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612083
28	NC_017640	GAAAT	2	10	4694	4703	60 %	20 %	20 %	0 %	386612084
29	NC_017640	TAA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612084
30	NC_017640	TAT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612084
31	NC_017640	CAA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612084
32	NC_017640	TCT	2	6	4779	4784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612084
33	NC_017640	A	6	6	4810	4815	100 %	0 %	0 %	0 %	386612084
34	NC_017640	CT	3	6	4816	4821	0 %	50 %	0 %	50 %	386612084
35	NC_017640	ATA	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612084
36	NC_017640	GAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612084
37	NC_017640	TTA	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612084
38	NC_017640	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
39	NC_017640	AT	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
40	NC_017640	GAT	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612084
41	NC_017640	ACTT	2	8	5144	5151	25 %	50 %	0 %	25 %	386612084
42	NC_017640	CAG	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612085
43	NC_017640	CTG	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612085
44	NC_017640	CGC	2	6	5820	5825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
45	NC_017640	CAGC	2	8	5933	5940	25 %	0 %	25 %	50 %	386612085
46	NC_017640	CAG	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612085
47	NC_017640	CAGG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	386612085
48	NC_017640	TG	3	6	6040	6045	0 %	50 %	50 %	0 %	386612085
49	NC_017640	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
50	NC_017640	CA	3	6	6148	6153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612085
51	NC_017640	GTG	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612085
52	NC_017640	CTG	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612085
53	NC_017640	GCTT	2	8	6247	6254	0 %	50 %	25 %	25 %	386612085
54	NC_017640	CGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
55	NC_017640	GGA	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612086
56	NC_017640	AGA	2	6	6487	6492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612086
57	NC_017640	CTG	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612086
58	NC_017640	GCA	2	6	6566	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612086
59	NC_017640	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	386612086
60	NC_017640	GGCTA	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	386612087
61	NC_017640	CAG	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612087
62	NC_017640	A	6	6	6909	6914	100 %	0 %	0 %	0 %	386612087
63	NC_017640	ATC	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612087
64	NC_017640	GAA	3	9	6996	7004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612087
65	NC_017640	A	6	6	7003	7008	100 %	0 %	0 %	0 %	386612087
66	NC_017640	AAG	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612087
67	NC_017640	CGT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612087
68	NC_017640	GCG	2	6	7094	7099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612087
69	NC_017640	GGT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612087
70	NC_017640	CTG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612087
71	NC_017640	CAG	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612087
72	NC_017640	GCTC	2	8	7262	7269	0 %	25 %	25 %	50 %	386612087
73	NC_017640	GAC	2	6	7297	7302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612087
74	NC_017640	TAT	2	6	7435	7440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612087
75	NC_017640	GAA	2	6	7536	7541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612087
76	NC_017640	CGC	2	6	7566	7571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612088
77	NC_017640	A	6	6	7595	7600	100 %	0 %	0 %	0 %	386612088
78	NC_017640	ATCAGT	2	12	7610	7621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612088
79	NC_017640	AAC	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612088
80	NC_017640	A	6	6	7638	7643	100 %	0 %	0 %	0 %	386612088
81	NC_017640	GCTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	386612088
82	NC_017640	GCGA	2	8	7714	7721	25 %	0 %	50 %	25 %	386612088
83	NC_017640	TGC	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612088
84	NC_017640	CT	3	6	7851	7856	0 %	50 %	0 %	50 %	386612088
85	NC_017640	CCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612088
86	NC_017640	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612088
87	NC_017640	ACC	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612088
88	NC_017640	GCC	2	6	8057	8062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612089
89	NC_017640	GTA	2	6	8064	8069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612089
90	NC_017640	CAGTG	2	10	8076	8085	20 %	20 %	40 %	20 %	386612089
91	NC_017640	CAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612089
92	NC_017640	T	8	8	8174	8181	0 %	100 %	0 %	0 %	386612089
93	NC_017640	GCA	3	9	8219	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612089
94	NC_017640	CAG	2	6	8265	8270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612089
95	NC_017640	TTGC	2	8	8290	8297	0 %	50 %	25 %	25 %	386612089
96	NC_017640	CTGG	2	8	8311	8318	0 %	25 %	50 %	25 %	386612089
97	NC_017640	CTG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612089
98	NC_017640	GTA	2	6	8402	8407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612089
99	NC_017640	ATT	2	6	9068	9073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612090
100	NC_017640	CTG	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612090
101	NC_017640	A	6	6	9092	9097	100 %	0 %	0 %	0 %	386612090
102	NC_017640	AAC	2	6	9170	9175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612090
103	NC_017640	CTG	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612090
104	NC_017640	GACAA	2	10	9286	9295	60 %	0 %	20 %	20 %	386612090
105	NC_017640	GCA	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612090
106	NC_017640	GCA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612090
107	NC_017640	ATT	3	9	9462	9470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612090
108	NC_017640	CAT	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612090
109	NC_017640	A	6	6	9553	9558	100 %	0 %	0 %	0 %	386612090
110	NC_017640	GAC	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612090
111	NC_017640	ATTC	2	8	9599	9606	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
112	NC_017640	A	7	7	9607	9613	100 %	0 %	0 %	0 %	386612090
113	NC_017640	ATC	2	6	9635	9640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612090
114	NC_017640	CGT	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612090
115	NC_017640	CTTA	2	8	9779	9786	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
116	NC_017640	CCA	2	6	9893	9898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612090
117	NC_017640	T	6	6	9997	10002	0 %	100 %	0 %	0 %	386612090
118	NC_017640	AT	3	6	10029	10034	50 %	50 %	0 %	0 %	386612090
119	NC_017640	GAT	2	6	10214	10219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612090
120	NC_017640	TAG	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612090
121	NC_017640	GGCA	2	8	10354	10361	25 %	0 %	50 %	25 %	386612090
122	NC_017640	TTA	2	6	10485	10490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612090
123	NC_017640	CAA	2	6	10507	10512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612090
124	NC_017640	ATA	2	6	10531	10536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612090
125	NC_017640	TTAT	2	8	10955	10962	25 %	75 %	0 %	0 %	386612091
126	NC_017640	TAC	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612091
127	NC_017640	TCA	2	6	10992	10997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612091
128	NC_017640	ACA	2	6	11095	11100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612091
129	NC_017640	CGC	2	6	11113	11118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612091
130	NC_017640	TTTC	2	8	11147	11154	0 %	75 %	0 %	25 %	386612091
131	NC_017640	GCA	2	6	11184	11189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612091
132	NC_017640	TTA	2	6	11190	11195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612091
133	NC_017640	TCCGCC	2	12	11196	11207	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386612091
134	NC_017640	TCA	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612091
135	NC_017640	TAA	2	6	11223	11228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612091
136	NC_017640	T	6	6	11282	11287	0 %	100 %	0 %	0 %	386612091
137	NC_017640	TTC	2	6	11301	11306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612091
138	NC_017640	CCA	2	6	11308	11313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612091
139	NC_017640	GCT	2	6	11350	11355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612091
140	NC_017640	CTT	2	6	11437	11442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612091
141	NC_017640	TGC	2	6	11458	11463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612091
142	NC_017640	CAC	2	6	11524	11529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612091
143	NC_017640	AAC	2	6	11547	11552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612091
144	NC_017640	GGA	2	6	11661	11666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612091
145	NC_017640	ATC	2	6	11687	11692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612091
146	NC_017640	GT	3	6	11758	11763	0 %	50 %	50 %	0 %	386612091
147	NC_017640	CAT	2	6	11809	11814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612091
148	NC_017640	GCA	2	6	11834	11839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612091
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150	NC_017640	CAA	2	6	12013	12018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612091
151	NC_017640	T	7	7	12041	12047	0 %	100 %	0 %	0 %	386612091
152	NC_017640	TCT	2	6	12156	12161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612091
153	NC_017640	GAC	2	6	12205	12210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612091
154	NC_017640	GTT	2	6	12289	12294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612091
155	NC_017640	CAG	2	6	12296	12301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612091
156	NC_017640	ACG	2	6	12323	12328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612091
157	NC_017640	TCT	2	6	12408	12413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612091
158	NC_017640	TTC	2	6	12422	12427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612091
159	NC_017640	AG	3	6	12518	12523	50 %	0 %	50 %	0 %	386612091
160	NC_017640	TGCGA	2	10	12539	12548	20 %	20 %	40 %	20 %	386612091
161	NC_017640	T	6	6	12595	12600	0 %	100 %	0 %	0 %	386612092
162	NC_017640	ACA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612092
163	NC_017640	GAG	2	6	12659	12664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612092
164	NC_017640	TCC	2	6	12732	12737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386612092
165	NC_017640	CATCAG	2	12	12763	12774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612092
166	NC_017640	TGT	2	6	12855	12860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612092
167	NC_017640	ATC	2	6	12945	12950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612092
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169	NC_017640	AGTGGA	2	12	13069	13080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386612093
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171	NC_017640	TTCT	2	8	13108	13115	0 %	75 %	0 %	25 %	386612093
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179	NC_017640	TTCAGC	2	12	13764	13775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386612094
180	NC_017640	AATA	2	8	13780	13787	75 %	25 %	0 %	0 %	386612094
181	NC_017640	GGC	2	6	13889	13894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612094
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185	NC_017640	T	7	7	14135	14141	0 %	100 %	0 %	0 %	386612095
186	NC_017640	GCC	2	6	14160	14165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612095
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195	NC_017640	CA	3	6	14804	14809	50 %	0 %	0 %	50 %	386612096
196	NC_017640	T	6	6	14814	14819	0 %	100 %	0 %	0 %	386612096
197	NC_017640	A	6	6	14858	14863	100 %	0 %	0 %	0 %	386612096
198	NC_017640	AAG	2	6	14877	14882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612096
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200	NC_017640	GATAT	2	10	15359	15368	40 %	40 %	20 %	0 %	386612097
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202	NC_017640	CTG	2	6	15395	15400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612097
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204	NC_017640	TCAGT	2	10	15613	15622	20 %	40 %	20 %	20 %	386612097
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220	NC_017640	CT	3	6	17095	17100	0 %	50 %	0 %	50 %	386612099
221	NC_017640	GTCT	2	8	17107	17114	0 %	50 %	25 %	25 %	386612099
222	NC_017640	TTC	2	6	17140	17145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612099
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235	NC_017640	TTA	3	9	18229	18237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612100
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240	NC_017640	T	7	7	18372	18378	0 %	100 %	0 %	0 %	386612100
241	NC_017640	A	8	8	18392	18399	100 %	0 %	0 %	0 %	386612100
242	NC_017640	TAC	2	6	18428	18433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612100
243	NC_017640	CAT	2	6	18469	18474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612100
244	NC_017640	CCA	2	6	18494	18499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612100
245	NC_017640	TCAC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	386612100
246	NC_017640	TCT	2	6	19453	19458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612101
247	NC_017640	AT	3	6	19465	19470	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
248	NC_017640	T	8	8	19502	19509	0 %	100 %	0 %	0 %	386612101
249	NC_017640	TTA	2	6	19513	19518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612101
250	NC_017640	ATG	2	6	19700	19705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612101
251	NC_017640	TAT	2	6	19763	19768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612101
252	NC_017640	TA	4	8	19786	19793	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
253	NC_017640	ATG	2	6	19829	19834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612101
254	NC_017640	AGG	2	6	19868	19873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612101
255	NC_017640	AT	3	6	19906	19911	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
256	NC_017640	TGAT	2	8	19937	19944	25 %	50 %	25 %	0 %	386612101
257	NC_017640	GA	3	6	20058	20063	50 %	0 %	50 %	0 %	386612101
258	NC_017640	TCA	2	6	20076	20081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612101
259	NC_017640	CAC	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612101
260	NC_017640	TCA	2	6	20104	20109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612101
261	NC_017640	GAG	2	6	20137	20142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612101
262	NC_017640	AT	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
263	NC_017640	ATCA	2	8	20177	20184	50 %	25 %	0 %	25 %	386612101
264	NC_017640	TCAG	2	8	20214	20221	25 %	25 %	25 %	25 %	386612101
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497	NC_017640	TG	3	6	35975	35980	0 %	50 %	50 %	0 %	386612113
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